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Linux认证:操作系统关于集群的安装与并行计算

发布时间:2011-05-31 10:19

  Linux认证:操作系统关于集群的安装与并行计算,安装过程就不多说了。需要注意的是安装时,如果机群不与联网则可以不考虑安全方面的因素而把rsh选为可信赖的服务,注意安装相应的软件包;如果还要与保持联网,出于安全需要应把ssh选为可信赖的服务。安装以后,应该各节点之间能够用ssh相互登录。每个节点的sshd都应该能正常提供服务。主机名:node1...noden(我所构建的系统n=2)

  在服务器节点public目录下建立mpi目录,并将其配置成NFS服务器,在/etc/exports文件中加入一行:

  在客户端节点的/etc/fstab文件中增加一行:

  将/public/mpi这个目录从服务器节点输出,并装载在各客户端,从而便于在各节点间分发任务

  3.修改/etc/hosts文件,将所有节点名称极其ip地址填入。例如:

  每个节点都进行类似的配置。这样做的目的是使节点之间能够通过node1...noden的名称相互访问。你可以通过pingnoden或sshnoden进行测试。

  将所有你允许访问本机进行mpi计算的机器名填入,一行一个机器名。这一步是为了使节点对其它的节点放权。

  例如,我的node1是我用于启动mpi集群计算的机器,其他的节点是参与计算者,在node1的/etc/hosts.equiv文件是这样的:

  192.168.1.1密码node1#给自己放权,这样在只有一台机器时也可以模拟并行计算

  首先决定一个用于启动集群计算的用户名,不提倡使用root进行集群计算。这里在每个节点上建立新用户chief,他们的主目录是/home/chief,必须采用同样的密码,将来的计算程序必须放在相同的径上。譬如你的程序为:fpi.f和a.out,则必须把a.out放在同样的境内,比如~/mpirun/a.out,每个节点都是如此。修改~/.bash_profile文件,主要是加入下列几行脚本:

  这里我们预定了将来mpich的运行安装在目录/usr/local/mpich下面。其余的三个变量是用来通知mpi运行采用rsh(或ssh)来作为远程shell。linux的运行到此就配置完毕了。

  对于采用rsh来作为远程shell运行MPI的用户只要在各个节点上都具有相同的用户,并把这一用户的密码设为空密码就可以运行了。

  若采用ssh作为远程shell则按如下配置:以你设定的用于启动mpi计算的用户登录,运行ssh-keygen,这将生成一个私有/公开密钥对,分别存放在~/.ssh/identity和~/.ssh/identity.pub文件内。然后进行访问授权,运行:

  在每个节点重复一遍。试着在某一节点上登录其它节点,sshnoden,则在.ssh/成一个known_hosts2文件,里面放着访问该主机的密钥,把所有密钥收集起来,在各个节点上作同样的拷贝。这样做的目的是使各节点相互之间访问无需输入密码。

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